Utilizzando Eclipse 3.0 con workspace appoggiato su una directory nfs, ottenevo un errore di "risorsa in uso" e il programma rifiutava di avviarsi.
Dalla mailing list di Eclipse ho appreso che è un problema del Java lock mechanism che non funziona correttamente con questo filesystem; per ovviare all'incoveniente ho avviato Eclipse con il seguente parametro aggiuntivo: -vmargs -Dosgi.locking=java.io
Funziona (per me ;-).